Au commencement le monde n'était que chaos. Le ciel et les eaux se séparerent. Puis vint Kunitokotachi, seigneur de toute choses et deux dieux subalternes. De ceux ci naquirent sept générations de couples frère-soeur. L'une des ces générations célestes (la septième) engendra la venue d'un couple divin sur Terre. Il s'agissait de Izanagi et de sa soeur jumelle-femme Izanami.
Un jour, alors qu'ils étaient sur le "pont des cieux" ("ama-no-ukihashi", peut-être l'arc-en-ciel?) et qu'ils se demandaient s'il se trouvait une terre en dessous d'eux, ils plongèrent une lance céleste richement décorée, Amenonuhoko, (représentant peut-être un éclair), et tâtonnant dans l'obscurité trouvèrent la surface de l'océan. Ils agitèrent alors la lance dans l'eau, et des gouttes de sel qui tombèrent se forma l'île d'Onogoro-Shima (ou Onogorojima) sur laquelle ils descendirent. La première île japonaise fut Awaji, et ainsi fut créé le "pays des huit grandes îles", les autres provenant de l'écume.
Sur cette terre, ils édifièrent une colonne et tournèrent autour, dans des directions opposées. Izanami parla la première au moment de leur rencontre et de leur union naquirent deux monstres. Ils refirent un tour de colonne, Izanagi parla le premier et cette fois naquirent de nombreux dieux parfaits et des îles du Japon. Mais à la naissance du dieu du soleil, Kagutsuchi no Kami, Izanami brûla et ses fluides vitaux devinrent des dieux
Fou de douleur, Izanagi tua son fils puis descendit dans le royaume des ténèbres, domaine des morts (Ne no Kuni ou Yomi Kuni) pour retrouver son épouse.
Mais celle-ci avait été rendue laide par la nourriture des morts ; elle accepta de le suivre avec l'autorisation des dieux s'il ne se retournait pas pour la regarder.
Mais le temps se faisant long, Izanagi s'impatienta. Il alluma une dent de son peigne pour s'en faire une torche et regarder ce qu'il se passait.
Il découvrit alors avec horreur le corps d'Izanami, en décomposition et rongé par les vers, dans lequel naissaient des tonnerres menaçants qui se mirent à sa poursuite. Il ne put leur échapper qu'en leur lançant son peigne et une pêche, et prit soin de refermer l'entrée de ce royaume avec un rocher.
Avant cela, il la répudia et Izanami lui jura que chaque jour elle tuerait 1000 sujets de son frère, celui-ci lui répondit qu'il en ferait naître en échange 1500 dans le même temps, créant ainsi le cycle de vie et de mort.
Il prit ensuite un bain pour se purifier de son contact avec la mort. Chaque vêtement abandonné donna naissance à un dieu, le lavage de ses paupières fit naître deux dieux, l'oeil gauche donna Amaterasu Omikami, la déesse solaire et l'oeil droit Tsukiyomi no Mikoto, le dieu lunaire ; enfin de son nez naquit Susanô no Mikoto, le dieu des tempêtes.
Amaterasu était la déesse favorite des puissances celestes et se vit confier le domaines des hautes plaines du Ciel, tandis que Tsukiyomi gouvernait la nuit et Susanô les mers.
Susanoo se montra odieux dès sa naissance et contesta le domaine de la déesse, insatisfait de ne régner que sur la Mer. Il brisa les métiers à tisser de sa s½ur Amaterasu, jeta un cheval écorché à travers son toit et déféqua dans sa maison, tua une de leur soeur et souffla une tempête sur son jardin. Humiliée, la déesse se retira dans une caverne, plongeant le monde dans les ténèbres. Le mal se mit alors à prospérer...
Les dieux et des déesses se réunirent près l'entrée de la caverne pour discuter du moyen de la faire sortir. Ils décidèrent de faire une grande fête. Ama no Uzume, la déesse de la gaieté, commerça à chanter et à danser lascivement; comme elle tourbillonnait, ses vêtements virevoltaient amplement. Ce spectacle tira des acclamations grivoises des huit millions de dieux et des déesses assemblés. Curieuse d'entendre tant de gaieté, Amaterasu Omikami jeta un coup d'oeil hors de la caverne. La déesse Uzume qui dansait toujours avait accroché un miroir octogonal à un arbre voisin, cria à la cantonade: "Que ce jour soit loué, nous avons enfin trouvé une déesse aussi brillante que l'illustre Amaterasu, pour la remplacer!"
Curieuse, Amaterasu sortit pour voir à quoi pouvait bien ressembler cette nouvelle déesse. En effet une déesse radieuse et lumineuse se tenait parmi les dieux et les déesses mais elle réalisa un peu trop tard que c'était que le reflet sa propre image dans le miroir. Alors Tajikarawo, dieu connu pour sa force, l'empêcha de retourner dans la caverne et les autres la supplièrent de ne jamais se cacher à nouveau.
Elle obtint en contrepartie que son frère fut banni que ses ongles lui fussent arrachés, et de plus ses propres descendants auraient la souveraineté du Japon.
Il fut alors chassé du Ciel et se réfugia en Izumo (ancienne province du Japon, aujourd'hui incluse dans la préfecture de Shimane) dont il devint le premier maître. Il y trouve un vieil homme et sa femme pleurant le sort de leur fille nommée Kushinada. Susanô leur en demande la raison. Le vieux couple explique qu'ils avaient à une époque huit filles, mais qu'un dragon nommé Yamatano-orochi, venu de Kosi avait mangé leur sept premières filles. Le terrible dragon avait huit têtes et huit queues. Et il réclamait sa dernière victime Susanô tomba amoureuse de la jeune fille et demanda sa main. Personne ne s'y opposa si ce n'est le dragon. Susanô construisit une muraille autour de la maison, avec huit ouvertures en son sein. Dans chaque ouverture il ordonna que l'on place une table avec sur chacune d'elle un grand vase rempli de saké distillé huit fois.
Le dragon, par l'odeur du vin alléché, se détourne de sa proie, boit le breuvage et sombre dans le coma éthylique. Susanô en profite pour pourfendre l'ignoble bête. Il découvrit dans le corps du dragon d'Izumo le dernier des trois trésors du Shintô, une épée appelée Kusanagi. Le sabre sera perdu en mer, lors du désastre des Heike à Dan no Ura en 1185, mais il continuera à figurer dans le trésor royal et sera présenté au dernier Empereur de Chine en 1940.
Par la suite, Amaterasu s'accoupla avec son frère Susanô après qu'ils se soient réconciliés. Ainsi naquit la seconde génération des divinités terrestres composées de trois déesses et cinq dieux.
Parmi ces derniers, Masaya Akatsu donna naissance à une lignée de divinités de laquelle émergea le premier empereur du Japon, un humain d'essence divine: Kamu Yamato ou Jimmu Tennô. Devenu roi d'Izumo, Susanoo fut contraint de donner le trésor à Amaterasu, qu'elle léguera à son tour à son petit fils, fondateur de la famille impériale japonaise, avant de se retirer dans le royaume des ténèbres.
Selon le Nihongi, l'empereur Jimmu, venu de Kyûshû par la mer, installa son domaine dans la grande plaine du Yamato (Aujoud'hui la partie sud de la préfecture de Nara). Et c'est le 11 février 660 avant JC qu'il monta sur le trône impérial. L'histoire du Japon commençait...


